优化高压MCR动态无功补偿装置的运行效率可以从以下几个方面进行：

1. **改进装置设计**：
- 采用的磁阀结构设计，如多磁阀串联，每个磁阀具有不同的长度和导磁面积，以减小电抗器输出电流的谐波含量。这种方法已被证明可以有效抑制谐波电流，将MCR的输出谐波含量值抑制在输出电流的2.8%以下。
- 优化磁控电抗器(MCR)的铁芯设计，通过调整铁芯的磁饱和程度来改变输出电流的大小和相位，进一步降低谐波的产生。

2. **提升控制系统性能**：
- 采用全数字控制系统，提高响应速度和控制精度。系统响应时间可达到20ms~60ms，装置能够快速响应电网的无功需求变化。
- 实现无功功率的精细调节，无功调节范围达到0～100%，使功率因数提高到0.92以上，从而提高电网的电能质量。

3. **增强装置可靠性**：
- 采用高质量的可控硅元件和光电触发技术，提高系统的抗干扰能力和运行稳定性。
- 设计后备微机保护和硬保护机制，装置在异常情况下能够安全退出运行，避免对电网造成不良影响。

4. **优化滤波支路设计**：
- 合理配置滤波支路的电容器和电抗器参数，以提供有效的容性无功补偿和滤波功能。这有助于降低系统电压波动和闪变，稳定系统电压。
- 根据系统实际情况，可将滤波支路设计为固定或自动电容器组滤波通道，以满足不同场合的需求。

5. **智能化管理与维护**：
- 引入远程监控和诊断系统，实时监测装置的运行状态，及时发现并处理潜在问题。
- 利用大数据和人工智能技术，对装置的运行数据进行分析和优化，提出针对性的改进建议，进一步提高运行效率。

综上所述，通过改进装置设计、提升控制系统性能、增强装置可靠性、优化滤波支路设计以及实施智能化管理与维护等措施，可以提升高压MCR动态无功补偿装置的运行效率，为电网的稳定运行和电能质量的提升提供有力保障。